Ну не может моя сестрёнка быть такой милой

17-летний Кёсукэ Косака давно не разговаривал со своей 14-летней сестрой Кирино. Причины этого разрыва он не понимал, но однажды Кирино начала избегать его, игнорируя все его попытки наладить общение. Казалось, их отношения навсегда ушли в прошлое.

Однажды Кёсукэ наткнулся на странный DVD с обложкой махо-сёдзё. Подозрения усилились, когда он обнаружил под обложкой эроге «Imouto to Koishiyo!» (рус. «Любовь с младшей сестрёнкой»). Попытка выяснить, чьё это может быть, во время семейного ужина провалилась. Все отрицали свою причастность, особенно отец, убеждённый антиотаку, работающий в полиции.

Ночью Кёсукэ проснулся от пощёчины от сестры, которая потребовала поговорить. В её комнате выяснилось, что диск принадлежит именно ей, а сама Кирино — тайная отаку, увлекающаяся махо-сёдзё и хентайными играми. Особенно её интересуют игры про любовь между братом и сестрой. Так началась новая глава в их отношениях, полных неожиданностей и секретов.